Où on parle (toujours) de génétique textuelle…

Recherche adaptative de structures de régulation génétique

Résumé. Nous avons proposé un algorithme original de Fouille de Données, LICORN, afin d’inférer des relations de régulation coopérative à partir de données d’expression. LICORN donne de bons résultats s’il est appliqué à des données de levure, mais le passage à l’échelle sur des données plus complexes (e.g., humaines) est difficile. Dans cet article, nous proposons une extension de LICORN afin ...

Adaptation d'un algorithme génétique pour la reconstruction de réseaux de régulation génétique : COGARE

RÉSUMÉ. Nous proposons une approche “algorithme génétique” pour la reconstruction génomique. Notre approche introduit le concept d’algorithmie génétique multi-échelle : l’optimisation est conduite simultanément à une échelle locale et à une échelle globale. La fonction d’efficacité est donc hybride. Notre approche prend également en compte plusieurs types de données, dynamiques, statiques, ou i...

GeniMiner, un moteur de recherche génétique

We present in this paper a genetic search strategy for a search engine. We begin by showing that important relations exist between Web statistical studies, search engines based on agent approach, and standard techniques in optimization: the web is a graph which can be searched for relevant information with an evaluation function and with operators based on creation or local exploration. It is t...

Institut de Génétique et Biologie Moléculaire et Cellulaire: IGBMC.

Outils de fouille textuelle à partir d'annotations sémantiques

L’exploitation automatique d’annotations sémantiques, effectuée selon des ontologies linguistiques contenant des points de vue tels qu’hypothèse, citation, méthode, résultat, ... permet de mettre en place de nouveaux produits documentaires, que nous appellerons fiches de synthèse ou bibliographie augmentée, offrant à l’utilisateur un aperçu structuré et synthétisé des contenus textuels correspo...